<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body dir="auto">
<div>That 13.04 AMI should be removed. All it does is cause confusion.</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
On Feb 20, 2015, at 12:54, Philip Montgomery &lt;<a href="mailto:pmontgom@broadinstitute.org">pmontgom@broadinstitute.org</a>&gt; wrote:<br>
<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div>
<div dir="ltr">I don't recall seeing any network errors, but I do regularly install R on top of starcluster AMIs. &nbsp; I have gotten errors trying to update packages, I'm guessing because the last ubuntu release that there's starcluster AMIs (13.04) for is no
 longer supported by ubuntu.&nbsp; So, I use the AMI for ubuntu 12.04 as my starting point.
<div><br>
</div>
<div>Attached is a script that I run which installs R and the various packages that I use.&nbsp; I then image the instance to a new AMI so that I don't need to repeat the process ever time a node comes online.</div>
<div><br>
</div>
<div>Not entirely clear if the problem you're getting is one I've hit, but sending along my script in case it happens to help.</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks,</div>
<div>Phil</div>
<div><br>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Fri, Feb 20, 2015 at 12:34 PM, <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:starcluster-request@mit.edu" target="_blank">starcluster-request@mit.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Send StarCluster mailing list submissions to<br>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; <a href="mailto:starcluster@mit.edu">starcluster@mit.edu</a><br>
<br>
To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; <a href="http://mailman.mit.edu/mailman/listinfo/starcluster" target="_blank">
http://mailman.mit.edu/mailman/listinfo/starcluster</a><br>
or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; <a href="mailto:starcluster-request@mit.edu">starcluster-request@mit.edu</a><br>
<br>
You can reach the person managing the list at<br>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; <a href="mailto:starcluster-owner@mit.edu">starcluster-owner@mit.edu</a><br>
<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than &quot;Re: Contents of StarCluster digest...&quot;<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
&nbsp; &nbsp;1. cannot install on master node (Vas Ku)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Fri, 20 Feb 2015 16:53:51 &#43;0000<br>
From: Vas Ku &lt;<a href="mailto:vaskum.tech@gmail.com">vaskum.tech@gmail.com</a>&gt;<br>
Subject: [StarCluster] cannot install on master node<br>
To: <a href="mailto:starcluster@mit.edu">starcluster@mit.edu</a><br>
Message-ID:<br>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &lt;CANXm8A3qUwmsjO7RVDMKgwiC588T7BhAR=d=<a href="mailto:vOP_ABVjLyrRQg@mail.gmail.com">vOP_ABVjLyrRQg@mail.gmail.com</a>&gt;<br>
Content-Type: text/plain; charset=&quot;utf-8&quot;<br>
<br>
Apologies for this rather novice question. I have finally been able to get<br>
star cluster installed and running after firefighting with different AMI's<br>
and thing. But now I am stuck with this issue where I need to install R and<br>
when i do apt-get, the networks seems to be dead. Not even ping works (just<br>
hangs any ip and dies with 'failed connection timeout' ) . Must be<br>
something obvious I haven't or have done with my config setting. Could you<br>
please let me know what diagnostics could I perform?<br>
<br>
Thanks<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <a href="http://mailman.mit.edu/pipermail/starcluster/attachments/20150220/86c834c3/attachment-0001.htm" target="_blank">
http://mailman.mit.edu/pipermail/starcluster/attachments/20150220/86c834c3/attachment-0001.htm</a><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
_______________________________________________<br>
StarCluster mailing list<br>
<a href="mailto:StarCluster@mit.edu">StarCluster@mit.edu</a><br>
<a href="http://mailman.mit.edu/mailman/listinfo/starcluster" target="_blank">http://mailman.mit.edu/mailman/listinfo/starcluster</a><br>
<br>
<br>
End of StarCluster Digest, Vol 66, Issue 7<br>
******************************************<br>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
<hr>
<pre>WARNING: This e-mail has been altered by MIMEDefang.  Following this
paragraph are indications of the actual changes made.  For more
information about your site's MIMEDefang policy, contact
Wharton Email Services &lt;<a href="mailto:postmaster@wharton.upenn.edu">postmaster@wharton.upenn.edu</a>&gt;.  For more information about MIMEDefang, see:

            <a href="http://www.roaringpenguin.com/mimedefang/enduser.php3">http://www.roaringpenguin.com/mimedefang/enduser.php3</a>

An attachment named setup_r.sh was removed from this document as it
constituted a security hazard.  If you require this document, please contact
the sender and arrange an alternate means of receiving it.

</pre>
</div>
</blockquote>
<blockquote type="cite">
<div><span>_______________________________________________</span><br>
<span>StarCluster mailing list</span><br>
<span><a href="mailto:StarCluster@mit.edu">StarCluster@mit.edu</a></span><br>
<span><a href="http://mailman.mit.edu/mailman/listinfo/starcluster">http://mailman.mit.edu/mailman/listinfo/starcluster</a></span><br>
</div>
</blockquote>
</body>
</html>