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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">Hi Jerry,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">Have you taken efforts to ensure that your cluster is started in the same availability zone as your EBS volume?<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">~Steve<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> starcluster-bounces@mit.edu [mailto:starcluster-bounces@mit.edu]
<b>On Behalf Of </b>Jerry Lee, GW/US<br>
<b>Sent:</b> Monday, April 15, 2013 5:12 PM<br>
<b>To:</b> starcluster@mit.edu<br>
<b>Subject:</b> [StarCluster] Unable to mount ebs volume<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Hi,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I am a beginner of using the StarCluster. I created a ebs volme via Amazon AWS and configure it on the config file to use it for my cluster, but no matter what I do, it doesn't automatically mount the ebs volume onto the cluster. Please
help.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">[cluster jerrycluster]<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">EXTENDS = smallcluster<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">VOLUMES = testdata<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">[volume testdata]<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">VOLUME_ID=vol-a0fe24f9<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MOUNT_PATH=/data<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Waiting for cluster to come up... (updating every 30s)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Waiting for instances to activate...<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Waiting for all nodes to be in a 'running' state...<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">2/2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Waiting for SSH to come up on all nodes...<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">2/2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Waiting for cluster to come up took 1.847 mins<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> The master node is ec2-54-234-229-206.compute-1.amazonaws.com<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Setting up the cluster...<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Configuring hostnames...<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">2/2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Creating cluster user: None (uid: 1001, gid: 1001)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">2/2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Configuring scratch space for user(s): sgeadmin<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">2/2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Configuring /etc/hosts on each node<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">2/2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Starting NFS server on master<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Configuring NFS exports path(s):<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">/home<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Mounting all NFS export path(s) on 1 worker node(s)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">1/1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Setting up NFS took 0.073 mins<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Configuring passwordless ssh for root<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Configuring passwordless ssh for sgeadmin<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Shutting down threads...<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">20/20 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Configuring SGE...<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Configuring NFS exports path(s):<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">/opt/sge6<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Mounting all NFS export path(s) on 1 worker node(s)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">1/1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Setting up NFS took 0.020 mins<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Installing Sun Grid Engine...<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">1/1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Creating SGE parallel environment 'orte'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">2/2 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Adding parallel environment 'orte' to queue 'all.q'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Shutting down threads...<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">20/20 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100%<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Configuring cluster took 1.325 mins<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> Starting cluster took 3.197 mins<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thanks,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:20.0pt;font-family:"Vladimir Script"">Jerry Lee<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">Jerry Lee<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">Assistant Manager of Global Infrastructure</span><span style="font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman","serif""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">GENEWIZ Inc.</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif"">40 Cragwood Road. Suite 201<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">South Plainfield, NJ 07080</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">Phone: 908-222-0711 ext. 3379<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">Fax: 908-333-4511
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""><a href="mailto:jerry.lee@genewiz.com">jerry.lee@genewiz.com</a></span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial","sans-serif""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><a href="http://www.genewiz.com/" title="blocked::http://www.genewiz.com/"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">www.genewiz.com</span></a><span style="font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman","serif""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"> <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:9.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">This electronic message, including its attachments, is confidential and proprietary and is solely for the intended recipient. If you are not the intended recipient, this message
was sent to you in error and you are hereby advised that any review, disclosure, copying, distribution or use of this message or any of the information included in this message by you is unauthorized and strictly prohibited. If you have received this message
in error, please immediately notify the sender by reply to this message and permanently delete all copies of this message and its attachments in your possession. Thank you for your cooperation.</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
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