<font color="#0000ff" face="Arial" size="2"><span></span></font>HI all, <br>Sorry for the delay in sending this out, but thanks to all the tips for ways to collect references and notes on-line, below are some recommendations from people,<br>
cheers, <br>John<br><br><b><a href="http://www.zotero.org">www.zotero.org</a><br></b> &gt;&gt; From Ricardo:<br> John says: I&#39;d looked at this Firefox plug-in before, but didn&#39;t think much of it, but it has had significant updates recently, watch the intro screen cast to see the features.  Just like endnote for keeping ref&#39;s but also allows you to easy grab any web page and store it locally, even annotate it with stickies.  This is the one that I&#39;ve gone with.  It almost has too many features and is not that intuitive to use, but great support if you need help.  <a href="http://Evernote.com">Evernote.com</a> below looks awesome too and I may try it for a lab notebook, particularly the search images function and the ability to scan in hand written notes.  Drawback; you have to pay to use it.<br>
<br> <br><b> <a href="http://www.evernote.com">http://www.evernote.com</a>). <br></b> &gt;&gt;Angela:<br>&quot;&quot;I&#39;ve just started to use a note-taking program called Evernote. You can download a trial from this site (<a href="http://www.evernote.com">http://www.evernote.com</a>). It&#39;s on special offer until January 15, 2008 (€19.95). So far I&#39;m really happy with it. You can type notes directly into it.  Drag and drop web clippings, excel and word files, image files.  You can also scan in images and docs - great for those scrappy pieces of paper I write things down on! (I haven&#39;t tested this yet though).  It has a very good search facility - even finding text in images.  It can be installed on a home and work computer and you can synchronize between computers using a usb thumb drive.  It also has a portable version which you can use on PCs that don&#39;t have the program installed.  See the links below for user stories from the user forum (<a href="http://forum.evernote.com/phpbb/viewtopic.php?f=23&amp;t=4990">http://forum.evernote.com/phpbb/viewtopic.php?f=23&amp;t=4990</a> ).  There are a few that might give you ideas for setting up a system that works for you.<br>
<br><b>A few others: <br></b> <a href="http://www.citavi.com/de/allgemeines/english.html">http://www.citavi.com/de/allgemeines/english.html</a><br>google notebook<br>TWiki ( personal wiki available for Mac and Win) and JabRef -<br>
<font color="#0000ff" face="Arial" size="2"><span><br>
<br>
</span></font>-- <br> John Cumbers, &nbsp;Graduate Student<br>Biology and Medicine <br>Brown University, Box G-W<br>Providence, Rhode Island, 02912, USA
<br>Tel USA: +1 401 523 8190, &nbsp;Fax: +1 401 863-2166 <br>UK to USA: 0207 617 7824
<br><br><div class="gmail_quote">On Jan 5, 2008 6:04 PM, John Cumbers &lt;<a href="mailto:johncumbers@gmail.com">johncumbers@gmail.com</a>&gt; wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Hi all, <br>So I&#39;m halfway through my PhD and I&#39;m just launching into some updated reading for an old project and I&#39;m looking at a better way to collect my notes together.&nbsp; I&#39;m hoping that there is a great new tool available that someone can tell me about to make my life easier... or at least a better strategy that someone has found to do this sort of research by...
<br><br>I want something to collect notes from meetings with my supervisor, experiments I plan to do, notes from reading, diagrams, references.&nbsp; Ideally something that would show me a list of notes I&#39;ve taken, in chronological order and also searchable via tags.
<br><br><i>Here are a few strategies that have <b>not </b>worked that well in the past.<br></i>Find papers via pubmed/hubmed/scholar<br>add papers to citeulike, many never end up getting read.<br>print out a few key pdf&#39;s on paper
<br>go through these, make notes on the paper itself, make notes on scratch paper<br>Write up key things on more scratch paper.&nbsp; <br>File some of the PDF&#39;s via citeulike ID number in filing cabinet...&nbsp; never to be looked at again..&nbsp; get on with lab work
<br>or... create stack of unsortable papers, get on with lab work<br>Lose papers in mass of other papers.&nbsp; lose notes.<br>repeat.<br>
<br>Next best thing might be a paper notebook like a lab book. But this gets equally as messy, although I could repeat this with an index to be move successful.&nbsp; But a paper book is not easily searchable.&nbsp; What about a word doc... argh... can you imagine...&nbsp; maybe there are better tools for Mac or Unix, but I&#39;m currently mostly on a PC.
<br><br>Can you help? Do you have a better strategy, or tool to recommend?&nbsp; I&#39;ve googled a few times for things like this but never found anything satisfactory.<br><br>Cheers, <br>John<br><font color="#888888"><br><br>
<br><br><br clear="all">
<br>-- <br> John Cumbers, &nbsp;Graduate Student<br>Biology and Medicine <br>Brown University, Box G-W<br>Providence, Rhode Island, 02912, USA<br>Tel USA: +1 401 523 8190, &nbsp;Fax: +1 401 863-2166 <br>UK to USA: 0207 617 7824
</font></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>John Cumbers, &nbsp;Graduate Student<br>Molecular Biology, Cell Biology, and Biochemistry<br>Biology and Medicine <br>Brown University, Box G-W<br>Providence, Rhode Island, 02912, USA<br>
Tel USA: +1 401 523 8190, &nbsp;Fax: +1 401 863-2166 <br>UK to USA: 0207 617 7824