<div dir="ltr"><br clear="all"><div>Hi Yarden,<br><br></div><div>I am running MISO on two groups of 3 samples each ((WT1, WT2, WT3, Mutant1, Mutant2 and Mutant3). I ran the steps up to summarize-samples on the individual samples. I want to run the differential expression step on the two groups.<br>
<br>Under FAQ, I see a description on how to run MISO on replicates. I was wondering if you could elaborate on how to pool samples within a group for downstream analysis. An example of run_miso.py command would be very helpful.<br>
<br></div><div>Thank you.<br><br></div><div>MP<br></div>
</div>