<!doctype html public "-//W3C//DTD W3 HTML//EN">
<html><head><style type="text/css"><!--
blockquote, dl, ul, ol, li { padding-top: 0 ; padding-bottom: 0 }
 --></style><title>Fwd: UROP Postion at Whitehead: contact
mekhail@mit.edu</title></head><body>
<blockquote type="cite" cite><br></blockquote>
<blockquote type="cite" cite>Project Description:&nbsp; We are using
Green Fluorescent Protein fused to RNA binding proteins to track and
analyze RNA and micro-RNA within cells.&nbsp; We do this by
genetically engineering these fusion proteins, observing them under a
variety of microscopy techniques, (such as confocal and cellomics
scanner), and then using a micro-array to determine the identity of
the RNA and micro-RNA.&nbsp; Micro-RNA is a very recent discovery, and
is a cellular method of gene suppression.&nbsp; We will also be
experimenting with novel micro-array methods to combine with a custom
wireless sensor that is being designed. We are making a unique version
of a customized micro-array reader using wireless imaging technology
to allow sensors to be directly integrated into fluidic and in-vivo
environments for detection of biological phenomena. &nbsp;This project
will allow the integration of visual information with micro-array data
to explore the characteristics of microRNA, as well as the effect of
drugs etc on gene suppression.&nbsp; </blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>What you will do:&nbsp; Take over the
genetic engineering of the GFP-RNA fusion proteins which is underway.
&nbsp;Learn to use confocal microscopy to track the in-vivo location
of the RNA and micro-RNA.&nbsp; Once the in-vivo characteristics are
established, micro-array experiments will be done to identify which
RNA and micro-RNAs are active.&nbsp; We will then use these micro-RNA
GFP fusions to investigate new ways to image micro-arrays with our
wireless sensor platform. </blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>Time Commitment:</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>Fall 2004:&nbsp; Come in to learn
techniques (cloning, tissue culture, etc). &nbsp;Likely ~ 5
hrs/week.</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>IAP 2005:&nbsp; Preferably last ½ of
IAP.</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>Spring 2005 - Spring 2006 (including
summer):&nbsp; Full UROP (i.e. ~ 10 hrs/week, more time is always
better).&nbsp; UROPS that stay over a long period (i.e. 1 year
generally get more out of it in terms of research, getting to know
your advisor, and being more productive than those staying for only a
semester), so I would prefer the intention to stay through spring
2006.</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>Experience:</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>Lab experience or lab class would be good
to have.&nbsp; Prefer someone who has done biological work before, ie
cloning, tissue culture etc., but if you are motivated that is the
primary characteristic and the rest can be learned.</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>Please email me ASAP.&nbsp; If you want
to get some credit for this semester, we have to complete the
paperwork by Thursday.&nbsp; Please include a resume if you have one,
and a list of relevant classes and grades.&nbsp; Please contact me
with any questions at Mekhail@mit.edu</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>About myself:</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>I am an MD/Ph.D. student working on
wireless biological sensors in combination with genetic engineering
for detection of biological phenomena.&nbsp; You will be working at
the Whitehead Institute with me and Prof. Paul Matsudaira.&nbsp; You
will also have access to the MIT Bioimaging center at 500 Tech square.
</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>Thanks,</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>Mekhail</blockquote>
<blockquote type="cite" cite>&nbsp;</blockquote>
<blockquote type="cite" cite><font
face="Times New Roman">&nbsp;</font></blockquote>
<div><br></div>
</body>
</html>